Ei, pellavansiemenöljyä ei pidä käyttää paistamiseen, hauduttamiseen eikä uunissa kypsentämiseen. Kuumennettaessa omega-3-rasvahapot, ennen kaikkea alfalinoleenihappo, hapettuvat ja hajoavat nopeasti – juuri ne ainesosat, joiden vuoksi öljy valitaankin. Lisäksi puhdistamattoman kylmäpuristetun öljyn savuamispiste on matala, minkä vuoksi se ei sovellu ruoanlaittoon liedellä.
Oikea käyttötapa on lisätä öljyä valmiisiin tai kylmiin ruokiin: sillä voi maustaa salaatteja ja puuroja sekä keitettyjä tai uunissa kypsennettyjä kasviksia, kun ne ovat jäähtyneet miellyttävään lämpötilaan, tai sen voi sekoittaa rahkaan tai jogurttiin. Näin rasvahapot säilyvät siinä muodossa, jossa ne tuotteessa ovat.
On myös tärkeää säilyttää öljy oikein: pidä se avaamisen jälkeen tiiviisti suljettuna jääkaapissa ja käytä pakkaukseen merkityn ajan kuluessa. Pellavansiemenöljy hapettuu nopeammin kuin moni muu kasviöljy – kitkerä tai eltaantunut haju kertoo, että tuote on pilaantunut eikä sitä kannata käyttää.