Ennen kuin šungiitti laitetaan veteen, se on huuhdeltava hyvin juoksevan veden alla – kunnes vesi on kirkasta. Tämä on tärkeää, koska mineraalin pinnalle voi jäädä louhinnan ja pakkaamisen jälkeen pieniä hiukkasia ja pölyä. Tätä vaihetta ei kannata ohittaa: ilman huuhtelua astian vesi voi muuttua sameaksi tai tummaksi.
Huuhtelun jälkeen šungiitti asetetaan kannun, lasipurkin tai muun sopivan astian pohjalle ja päälle kaadetaan vettä. Mitään lisälaitteita tai kulutustarvikkeita ei tarvita.
Vaihtamisesta: mineraalin adsorptiokyky heikkenee ajan mittaan, koska sen pinta kyllästyy vähitellen siihen sitoutuneista epäpuhtauksista. Valmistaja suosittelee vaihtamaan mineraalin 2–3 kuukauden säännöllisen käytön jälkeen. Seuraa myös veden maun tai kirkkauden muutosta – jos ne ovat heikentyneet käytön alkuun verrattuna, on aika vaihtaa mineraali. Säännöllisessä käytössä mineraali suositellaan uusimaan ajoissa odottamatta, että tulos selvästi heikkenee.
Käyttämätöntä šungiittia on parasta säilyttää kuivassa paikassa vierailta hajuilta suojassa – mineraali on huokoinen ja voi imeä niitä itseensä.